279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1818 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  64.66 
 
 		 290 aa  301  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  61.02 
 
 		 297 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  63.73 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  64.91 
 
 		 297 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  61.54 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  60.63 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  60.63 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  62.37 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  48.9 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.43 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  32.72 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  32.52 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  32.37 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  29.41 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  32.37 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  32.37 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  30.28 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  34.27 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  29.58 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  30.5 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  31.67 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  28.68 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  28.98 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  29 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  31.65 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  31.29 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  32.85 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  26.8 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  30.18 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  26.87 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  28.26 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  29.24 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  29.24 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  29.24 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  28.06 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.33 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25.66 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  26.62 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.07 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.63 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  29.14 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  25.2 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24.47 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.05 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.47 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  27.21 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.05 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.05 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.46 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.21 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  29.89 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.21 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.43 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  27.74 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  29.74 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.07 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  30.13 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.07 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  31.32 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  31.47 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  29.3 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.32 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  32.12 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  29.92 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  28.93 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  27.98 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.06 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  27.23 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  25.66 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.61 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  27.56 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  26.34 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.08 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.91 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0900  hypothetical protein  29.38 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  26.34 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  26.52 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.09 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>