267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1904 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  100 
 
 		 299 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  91.38 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  72.13 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  72.7 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  70.71 
 
 		 296 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  70.37 
 
 		 296 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  63.73 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  66.55 
 
 		 290 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  73.5 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  52.35 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  31.51 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  31.51 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  31.48 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  32.72 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  30.48 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  30.63 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  29.69 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  32.84 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  32.13 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  28.36 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  29.79 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  29.79 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  29.21 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  29.79 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  30.69 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  29.06 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  29.82 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  30.03 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  31.32 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  31.2 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  29.75 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  26.78 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  27.59 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.8 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.29 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  32.27 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  32.11 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.88 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.04 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  23.59 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  32.59 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  24.89 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  28.26 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  26.26 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  27.96 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25.48 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  23.81 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.81 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.05 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.12 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.37 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.96 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  30.22 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.37 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.75 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.37 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  28.86 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.9 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.9 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  29.7 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.69 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  29.34 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  21.92 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  29.62 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.58 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.58 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.58 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  29.96 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  29 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.24 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.49 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  24.88 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.55 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  25.79 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  29.89 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  30.9 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  24.34 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>