290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2759 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  96.98 
 
 
298 aa  527  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  96.31 
 
 
298 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  83.33 
 
 
301 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  75.44 
 
 
292 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  74.04 
 
 
292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  71.36 
 
 
219 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  57.35 
 
 
305 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.91 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  45.59 
 
 
297 aa  212  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1509  hypothetical protein  85.29 
 
 
82 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.585476  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.04 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  29.6 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.16 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  27.8 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  27.8 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  28.25 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  27.8 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  27.44 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  28 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.44 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  27.27 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.71 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.67 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  26.57 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  29.23 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  24.17 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.56 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.71 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.26 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  30.77 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  26.19 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  26.19 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.45 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.78 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  26.32 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.69 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  24.2 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2396  hypothetical protein  72.73 
 
 
49 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27.78 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.17 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  29.04 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.31 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.43 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  24.13 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  29.29 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  24.48 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  27.71 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  27.87 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25.08 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  28.28 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  24.1 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  24.38 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  30.19 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  30.66 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  22.64 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.54 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.37 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  23.42 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  26.26 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.72 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  28.03 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  27.72 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  26.69 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.37 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  23.73 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  23.42 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  25.75 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  23.73 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  23.73 
 
 
303 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.73 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  23.73 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  25.68 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.67 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 
313 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.96 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.42 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.82 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.01 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  23.42 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  24.13 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  24.1 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.29 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  25.37 
 
 
343 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  27.34 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  26.39 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>