More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_160 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  90.57 
 
 		 297 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  90.91 
 
 		 300 aa  531  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  39.64 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  38.33 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  38.44 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.73 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.1 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.63 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.77 
 
 		 295 aa  158  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  32.98 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  32.63 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  32.98 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  34.03 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  32.63 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  32.63 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  35.52 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  32.29 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  32.64 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  38.33 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  34.44 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.96 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  30.58 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  30.82 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  30.1 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  30.14 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  30.14 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  30.14 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  30.14 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  30.14 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  30.14 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  30.14 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  29.79 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.36 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  34.24 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.91 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  32.86 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.85 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.45 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  39.83 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  37.24 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.27 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  31.89 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  26.92 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  25.76 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.01 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  32.27 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  25.76 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  30.5 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  26.03 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  30.29 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  37.29 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  26.52 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.67 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  27.24 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  27.24 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  25.18 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.72 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  25.35 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  32.52 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  31.56 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  25.17 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  27.87 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.91 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  24.53 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.65 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  24.9 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  29.72 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  29.81 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  28.11 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.32 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  26.56 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  29.87 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>