257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0453 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  43.75 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  43.36 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  46.84 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  46.1 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  45.35 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  43.99 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  44.56 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  45.55 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  42.79 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  24.5 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  27.07 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  25 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  27.76 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  27.76 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  25.26 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  26.55 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.42 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  28.36 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.38 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.08 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.08 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3175  hypothetical protein  29.72 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  25.95 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.14 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  28.22 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  25.35 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  24.83 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  28 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  26.22 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.22 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  28.77 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.76 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  26.55 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  27.76 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.98 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  28.47 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  28.17 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.86 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  28.72 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  27.56 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.44 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  27.49 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2396  hypothetical protein  70 
 
 		 49 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.88 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  26.2 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.03 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.94 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  25.46 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  27.24 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.64 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  26.09 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  22.97 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  26.81 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  25.29 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  27.14 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  31.87 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  25.09 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  27.31 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  28.04 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  27.45 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.93 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  29.32 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  26.04 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  26.97 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  26.04 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  27.49 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  25.28 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  26.04 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  26.12 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  26.04 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.04 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  26.04 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.18 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  26.04 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  26.04 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>