More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4453 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  567  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.01 
 
 		 301 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  70.99 
 
 		 301 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.39 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.39 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.79 
 
 		 298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  55.71 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  56.01 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.86 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  51.35 
 
 		 319 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  51.01 
 
 		 319 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  51.01 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  51.01 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  51.01 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  51.35 
 
 		 325 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  51.69 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  46.05 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  47.64 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  48.15 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  47.81 
 
 		 312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  49.81 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  49.81 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  49.81 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  48.96 
 
 		 236 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  51.05 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.68 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.39 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.67 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  34.68 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  33.77 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  32.78 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  32.78 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  32.45 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  33.11 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  34.23 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  33.56 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  33.56 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  33.56 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  32.65 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  31.1 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  27.18 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  35.69 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  29.73 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  26.85 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  30.92 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  32.86 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  30.33 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  24.26 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  36.69 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  30.39 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  30.03 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  30.59 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.87 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  29.61 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  29.32 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  32.33 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  30.07 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.76 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.81 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.42 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.89 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.8 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.43 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.61 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.22 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.61 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.59 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.18 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.33 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  31.41 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  30.95 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  37.01 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  37.01 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  22.92 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  22.92 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.2 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.86 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.05 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.52 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.23 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.52 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.03 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.53 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.36 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  30.66 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  22.57 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.22 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>