More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0574 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  583  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.11 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.01 
 
 		 321 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.02 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.09 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  36.86 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  34.77 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  35.55 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  37.75 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  31.27 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  31.44 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  37.59 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  33.77 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2881  hypothetical protein  53.41 
 
 		 162 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  30.1 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  36.99 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  29.23 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  31.56 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.03 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  30.39 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  32.68 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  34.47 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.27 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  28.57 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.98 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  31.48 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.76 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  32.26 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  28.9 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  33.9 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  30.69 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.94 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  26.15 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  30.2 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  36.32 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  31.47 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  34.05 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  28.75 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  31.4 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.62 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  30.57 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  28.63 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  35.06 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2994  hypothetical protein  31.4 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263501  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.73 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.18 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  24.82 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.68 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.61 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  29.61 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  28.39 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  28.83 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.03 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  27.07 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.03 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.03 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.03 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.03 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  27.07 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.22 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  25.18 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  29.7 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  27.3 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.3 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.56 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.3 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  28.22 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.3 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  26.47 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  27.3 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.3 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.72 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  28.85 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.3 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  29.12 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.29 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.29 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.3 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.27 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  26.03 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  24.67 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>