150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5090 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  84.46 
 
 		 306 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  83.11 
 
 		 306 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.33 
 
 		 329 aa  261  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  40.13 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  42.76 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  40.8 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  41.69 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  40.47 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  40.74 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  41.37 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  42.21 
 
 		 512 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  40.13 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.05 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.16 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.46 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  37.85 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  41.48 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  40.47 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  38.95 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  39.46 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  41.34 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  41.28 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  38.38 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  40.45 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  39.8 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  36.79 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  36.79 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  42.23 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  36.46 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  42.44 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  39.49 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  38.3 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  37.87 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  33.89 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.68 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  34.29 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  31.56 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  31.56 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  28.93 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  31.94 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  31.56 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  31.56 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  29.86 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  31.18 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.09 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.57 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.57 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  29.43 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  34.43 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.47 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  27.24 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.12 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  27.86 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.37 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.73 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.02 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.88 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  27.37 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.06 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.14 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.65 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.35 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.66 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  22.99 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  27.14 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.76 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.54 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  23.44 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  21.63 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  21.05 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  23.05 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  27.5 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.99 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  21.75 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  21.4 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.23 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.24 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.91 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.66 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  27 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.22 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  28.86 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.4 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  22.57 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  25.12 
 
 		 219 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  23.94 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  26.57 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  22.57 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  24.11 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>