229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2348 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  99.33 
 
 
300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  99.67 
 
 
300 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  89.37 
 
 
301 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  92.67 
 
 
300 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  90.33 
 
 
300 aa  500  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  90.33 
 
 
300 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  79.05 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  79.05 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  79.05 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  74.92 
 
 
299 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  78.98 
 
 
306 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.98 
 
 
299 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  59.31 
 
 
302 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  56.9 
 
 
298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.3 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.3 
 
 
300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  54.95 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  54.95 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  54.2 
 
 
298 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  56.39 
 
 
304 aa  288  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  52.76 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  54.86 
 
 
299 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.45 
 
 
300 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.25 
 
 
300 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  54.76 
 
 
298 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  54.03 
 
 
308 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  54.76 
 
 
299 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 
329 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  58.01 
 
 
255 aa  254  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  51.22 
 
 
304 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  40.47 
 
 
312 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  50.37 
 
 
272 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  40.13 
 
 
307 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  42.47 
 
 
295 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.53 
 
 
306 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  38.85 
 
 
306 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  29.37 
 
 
311 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  30.71 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  30.71 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.54 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  30.36 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  30.66 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.66 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.76 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.93 
 
 
300 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.16 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.57 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  28.47 
 
 
281 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  37.07 
 
 
315 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.68 
 
 
307 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  31.39 
 
 
293 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  32.71 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.62 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  27.14 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  30.95 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.36 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  24.73 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  28.85 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.97 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.94 
 
 
397 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  28.45 
 
 
304 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.96 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  30.22 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.41 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  27.44 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.55 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.65 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.95 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 
299 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 
300 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  29.02 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.93 
 
 
324 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 
299 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  28.17 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  28.63 
 
 
395 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 
300 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.38 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.69 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.69 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  28.95 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  23.38 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 
321 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  26.09 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.6 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25.84 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.18 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.93 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.76 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.15 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.23 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.23 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  25.56 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>