222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2873 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  99 
 
 		 300 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  90.33 
 
 		 300 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  90.67 
 
 		 300 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  90.33 
 
 		 300 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  93.33 
 
 		 300 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  89.04 
 
 		 301 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  75.93 
 
 		 299 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  79.93 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  79.93 
 
 		 343 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  79.59 
 
 		 343 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  79.52 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.78 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  57.97 
 
 		 302 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  55.59 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.35 
 
 		 313 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.35 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  54.55 
 
 		 298 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  54.95 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  54.95 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  53.47 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.1 
 
 		 300 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  54.89 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.21 
 
 		 300 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  51.71 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  54.76 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  55.4 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.42 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  53.06 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  57.14 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  51.92 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  39.67 
 
 		 312 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  49.63 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.2 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  39.8 
 
 		 307 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  43.49 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  40.07 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  29.64 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  29.64 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  29.29 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.56 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.89 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  29.56 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.2 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  28.11 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.22 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.9 
 
 		 313 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.7 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  28.47 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.79 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  31.6 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  36.45 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  30.91 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.48 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.99 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  27.84 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.68 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  30.65 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.3 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.91 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  24.82 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  28.27 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.98 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  24.81 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  29.29 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.68 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.71 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.32 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  27.46 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  25.26 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.9 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  25.86 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  24.43 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  24.43 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.63 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  24.43 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  24.43 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  24.89 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.86 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.63 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.36 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  25.11 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  26.74 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.95 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  29.63 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  24.43 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  22.54 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.38 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>