111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6434 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  590  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.25 
 
 		 301 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  37.92 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  29.18 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  29.03 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  27.48 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  28.42 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  30.66 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.64 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  30.1 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  29.43 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  29.15 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  29.77 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  26.86 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  27.92 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  27.27 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.67 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.18 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  27.8 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.73 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  27.93 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  27.11 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.98 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.26 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  25.81 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  25.52 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  23.83 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  26.19 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27.64 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  25.68 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  23.38 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  25.63 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.78 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  27.4 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  27.4 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  25.5 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  25.1 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  23.08 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  23.08 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.27 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  26.69 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  26.27 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  22.93 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.61 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.4 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  23.44 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.04 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  25.1 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.71 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  25.94 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.34 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  23.23 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  24.7 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  22.81 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  24.7 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  27.13 
 
 		 512 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  24.7 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  27.04 
 
 		 343 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  25.6 
 
 		 300 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  20.75 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.25 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.84 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.23 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  24.69 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  23.98 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  29.05 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.35 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  23.58 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.81 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  26.03 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  25.18 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  26.67 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  28.49 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  25.52 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  25.96 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  24.75 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  27.23 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>