59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2752 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 309 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  71.77 
 
 		 291 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  74.2 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  71.09 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  68.71 
 
 		 291 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.38 
 
 		 294 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  67.7 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  59.14 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  58.6 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  28.21 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  28.21 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  25.95 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.51 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.82 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  26.87 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.85 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  28.93 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  23.26 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.51 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.43 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  25.88 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  36.52 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.32 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  29.94 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  24.44 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  24.44 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.78 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  36.52 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  28.23 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.84 
 
 		 282 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  23.23 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  29.26 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  20.57 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  27.11 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  35.65 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  34.17 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  27.74 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  24.91 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  29.94 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.3 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  37.8 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  23.53 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  22.71 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.39 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.33 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25.69 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  22.8 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  26.28 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>