135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1435 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  97.87 
 
 
282 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  97.52 
 
 
282 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  74.44 
 
 
281 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  40.84 
 
 
307 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.76 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  33.92 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.56 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  33.67 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  29.86 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  28.38 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  27.49 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  33.94 
 
 
290 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  27.68 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0829  hypothetical protein  33.87 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  27.92 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  28.57 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  29.75 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0433  hypothetical protein  25.73 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  31.27 
 
 
280 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.1 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.48 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  32.31 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  31.16 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0534  hypothetical protein  36.8 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.055739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.5 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  29.9 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1445  hypothetical protein  34.92 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.154622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  28.08 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  30.05 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  32 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
309 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  32.55 
 
 
270 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  31.92 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  31.36 
 
 
297 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  25.51 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.7 
 
 
259 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  27.31 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  28.05 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  26.52 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  27.31 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  34.36 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.41 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  28.84 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  29.6 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.05 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  30.91 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  32.95 
 
 
290 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  27.85 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.44 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.27 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  26.7 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  27.7 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.32 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1171  hypothetical protein  29.68 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  29.13 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  27.75 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  27.75 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  21.29 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.59 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  21.63 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.76 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  36.42 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  28.83 
 
 
299 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  29.53 
 
 
302 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  32.02 
 
 
293 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  26.09 
 
 
301 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.02 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  38.52 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.05 
 
 
289 aa  46.2  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  28.18 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  27.57 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  37.04 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.31 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  43.75 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  30.54 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  29.7 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  21.54 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  38.2 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  29.48 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0401  hypothetical protein  27.16 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.96 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3614  integral membrane protein  23.56 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  28.24 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>