77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0401 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0401  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3031  hypothetical protein  36.95 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1567  DMT family permease  37.04 
 
 
173 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1568  hypothetical protein  43.64 
 
 
114 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3025  hypothetical protein  41.98 
 
 
131 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  23.33 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 
323 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.8 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  24.05 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  25.24 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  23.86 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  25.73 
 
 
306 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 
304 aa  52.8  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.68 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 
293 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.61 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.79 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  21.84 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  22.81 
 
 
309 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  24.38 
 
 
288 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  22.18 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  21.5 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  23.34 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.85 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  26.64 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  26.43 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  38.81 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  25.16 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  25.51 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0332  hypothetical protein  24.2 
 
 
301 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0350  hypothetical protein  24.2 
 
 
301 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.73 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.65 
 
 
290 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  25.55 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.28 
 
 
259 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  23.34 
 
 
292 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 
305 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  32.1 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  25.66 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  25.25 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  25.89 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.2 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  30.37 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  24.2 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  24.6 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  24.2 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18490  DMT family transporter: drug/metabolite  28.57 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00171701  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.2 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  24.76 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  25.11 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0625  hypothetical protein  39.13 
 
 
237 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.95 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.1 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  37.31 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.72 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  39.13 
 
 
331 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  22.39 
 
 
219 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  23.89 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  24.51 
 
 
311 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 
297 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.1 
 
 
309 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  22.49 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  29.89 
 
 
309 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  26.52 
 
 
297 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25.58 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.74 
 
 
338 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>