122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5086 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 338 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  71.1 
 
 		 321 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.81 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  31.72 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  30.1 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  30.61 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  29.14 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  28.75 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  30.3 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  29.37 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.34 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.71 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  31.96 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  36.11 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.15 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  22.9 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.08 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  23.96 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  22.64 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  30.4 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  30.4 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  27.35 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.44 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  26.54 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  24.84 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  27.24 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  24.31 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.17 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  25.95 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.81 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  31.47 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  31.47 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  30.28 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  31.47 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.03 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  22.95 
 
 		 297 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.21 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  21.92 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  24.58 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  23.47 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  20.77 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.01 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  26.32 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.6 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.86 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.35 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.17 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  29.47 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.56 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.28 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  27.8 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  32.94 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  28.76 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.51 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  30.32 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  31.25 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  36.44 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.5 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  25.08 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  36.44 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  36.44 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.14 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  32.94 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  24.17 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  30.49 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  32.94 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  27.08 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  36 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  27.98 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  31.4 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  25.49 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  32.09 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  36 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>