110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2661 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  80 
 
 		 300 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  43.46 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.55 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  42.61 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  40.22 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  37.77 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  38.73 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  42.46 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.24 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  29.7 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.81 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  32.14 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  30.19 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.45 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  26.26 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  28.37 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  28.81 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  31.43 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  32.18 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  31.62 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  27.41 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  31.72 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  34.4 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  32.58 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  30.97 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.22 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  27.33 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  31.21 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  22.48 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  25.44 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  29.38 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  31.09 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  36.04 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  30.48 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  32.71 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0514  hypothetical protein  35.77 
 
 		 141 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  29.82 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.46 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  31.77 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.82 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.92 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  24.23 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  27.24 
 
 		 345 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  29.82 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.6 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  29.55 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.72 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1035  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.96 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  31.87 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.4 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  31.6 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  30.3 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.98 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  32.98 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  26.57 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  29.73 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  28.08 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  29.35 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  24.32 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  23.47 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  24.06 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  23.28 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  32.55 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  25.97 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  29.89 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  28.2 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  29.53 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.92 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  28.57 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>