86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2974 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.23 
 
 
327 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 
300 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  41.34 
 
 
299 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  38.08 
 
 
305 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  36.56 
 
 
288 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  39.39 
 
 
311 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 
301 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  31.67 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.09 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  30.59 
 
 
291 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  29.3 
 
 
281 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  31.67 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  27.53 
 
 
306 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.24 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  33.66 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  26.46 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  27.24 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  25.7 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24.43 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  31.34 
 
 
168 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  30.04 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 
286 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.61 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  25.69 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.33 
 
 
306 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  31.46 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  33.77 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.61 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.13 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  24.52 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.63 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.37 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.7 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  25.95 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.67 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  37.35 
 
 
301 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  24.88 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.88 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  24.78 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  25.18 
 
 
316 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.83 
 
 
297 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  30.29 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  30.29 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1262  hypothetical protein  31.13 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.18 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  33.73 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  32.43 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.83 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  27.78 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  27.78 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.73 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  31.65 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  31.94 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.98 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  27.78 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  22.44 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  30.54 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0071  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  26.73 
 
 
317 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1035  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.05 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  30.84 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  28.06 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.36 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  26.76 
 
 
312 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  27.63 
 
 
297 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  26.29 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>