87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000531 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000531  permease  100 
 
 		 308 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  76.62 
 
 		 308 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  35.59 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  27.46 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  31.9 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  28.48 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  28.62 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  28.25 
 
 		 307 aa  99  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  32.47 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  27.89 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  26.96 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  27.84 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  29.51 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  25.7 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  28.32 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  25.94 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.54 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  24.66 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  26.79 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.73 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  24.18 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  21.4 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.14 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  25.68 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  26.35 
 
 		 168 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  25.59 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  25.33 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.51 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.41 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  24.83 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  21.4 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  23.78 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  21.63 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  25.17 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  25.17 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  24.39 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.19 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.84 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  24.04 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.19 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  24.04 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  24.04 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.18 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  23.08 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.4 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  22.26 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  24.6 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  22.56 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.17 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.69 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  23.69 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.69 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.69 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  24.14 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  23.73 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  30.14 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.94 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.37 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  23.67 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.3 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  22.48 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.4 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  22.58 
 
 		 341 aa  42.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>