73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0944 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.36 
 
 		 301 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  51.19 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  35.94 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  35.11 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.79 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  35.09 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  29.04 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  30.61 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  33.45 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  36.55 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  32.33 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  32.12 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  31.01 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  23.33 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  30.26 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  23.53 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.66 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  25.58 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  33.17 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  29.15 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.99 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.84 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  29.64 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  21.3 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  31.95 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.15 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  30.49 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.49 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  28.72 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.62 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.45 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.29 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.29 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.63 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  27.34 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  29.14 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  29.31 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  28.18 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  29.8 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.04 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.65 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.29 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  25.85 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4395  EamA family protein  23.65 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4903  eama family protein  24.63 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.6 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  24.32 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  27.48 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4549  EamA family protein  24.63 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>