70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1093 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.36 
 
 		 301 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  51.22 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.56 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  34.28 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  36.92 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.07 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.08 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  31.97 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  30 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  34.16 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  34.56 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  36.75 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.66 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  30.94 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  31.48 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  23.16 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  28.48 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  29.49 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  24.03 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  28.26 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  25.58 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.24 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  29.69 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  30.03 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.65 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.03 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.46 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.21 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.63 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  26.89 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.75 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  29.83 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.71 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  20.37 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  23.92 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.59 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  28.23 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  24.58 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.61 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  21.92 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  31.66 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  29.39 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4395  EamA family protein  22.96 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  27.44 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  27.65 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.8 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  28.52 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  30.9 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  24.47 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.01 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  22.79 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4549  EamA family protein  22.45 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  27.55 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4903  eama family protein  22.45 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4786  transporter, EamA family  21.94 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>