60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3503 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  604  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  49.67 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  37.28 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  29.31 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  28.25 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  30.34 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  25.45 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  26.46 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  25.45 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  30.19 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  27.18 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  26.79 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.23 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  31.67 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.96 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  27.68 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  24.75 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  22.46 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24.63 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.53 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  23.65 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.91 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  23.96 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  29.23 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  24.31 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.79 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  29.03 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  27.37 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.03 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  27.84 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  22.92 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  22.92 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  23.67 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.67 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  23.67 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  23.45 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.83 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  25.27 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  23.67 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.67 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  24.27 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  24.55 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.49 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.37 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  25.34 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.22 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  22.85 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.47 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  24.83 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.85 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  24.18 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>