105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0190 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.1 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  35 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  31.76 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  31.54 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.22 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  29.44 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  29.51 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  29.64 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.2 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  27.8 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  31.33 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  26.79 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.18 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  27.18 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  31.18 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.73 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.62 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  36.17 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.57 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  22.71 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  23.51 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  24.58 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.86 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.75 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  30.36 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  25.53 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  27.69 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  23.62 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  32.26 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  27.85 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  26 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  24.22 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.73 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  25.91 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  25.69 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  25.84 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.3 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  30.39 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.92 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  26.37 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.55 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  26.9 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  26.27 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  27.54 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  21.01 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.75 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  26.27 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  25.81 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.96 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  26.27 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  21.32 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.65 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.96 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  26.49 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  26.69 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  34.15 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.39 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.49 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2398  hypothetical protein  25.62 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0774988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  25.51 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.92 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  26.04 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  24.17 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  21.17 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  26.27 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  26.28 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  28.14 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>