More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1258 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  29.59 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  29.59 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  29.93 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  29.59 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  29.59 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  29.59 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  29.59 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  29.93 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  29.59 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  29.59 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  29.25 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  31.93 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  31.31 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  29.59 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.67 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.33 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 283 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  30.64 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  30.64 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  28.1 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.94 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.28 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.21 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.25 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  27.86 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  27.86 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  22.97 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  22.97 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  23.31 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.03 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.03 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.03 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.03 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.32 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.03 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.67 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  30.48 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  27.86 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  26.86 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  27.41 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  26.6 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.45 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  31.03 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  26.46 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  26.49 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  23.32 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.91 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.09 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  25.52 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  29.29 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  27.15 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.85 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  27.36 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  26.46 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4605  transporter, EamA family  27.3 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4387  EamA family protein  27.3 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4726  eama family protein  27.3 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  23.97 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  24.06 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  27.3 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.41 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  27.73 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  28.12 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  26.42 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  28.16 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  26.62 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  26.73 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  25.16 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.08 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  25.75 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  25.65 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.71 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.74 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  24.14 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  26.89 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  25.1 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  23.51 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  25.1 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  25.1 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>