286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3469 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  76.92 
 
 
300 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.57 
 
 
302 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.08 
 
 
289 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  70.23 
 
 
299 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  66.56 
 
 
300 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  61.62 
 
 
302 aa  325  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  49.66 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.36 
 
 
312 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  50.64 
 
 
317 aa  235  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  45.85 
 
 
297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  45.15 
 
 
319 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3051  DMT family permease  53.38 
 
 
321 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.300875  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  35.19 
 
 
301 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  39.2 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  37 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  36.84 
 
 
329 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  37.85 
 
 
313 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  34.98 
 
 
345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  40.21 
 
 
308 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  36.59 
 
 
299 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  34.63 
 
 
306 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  36.05 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.66 
 
 
309 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  35.41 
 
 
310 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 
291 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.93 
 
 
301 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  34.71 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  35.4 
 
 
311 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  31.38 
 
 
309 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  34.78 
 
 
294 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  37.93 
 
 
310 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.28 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  34.58 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  33.57 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  36.96 
 
 
312 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  34.49 
 
 
294 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 
310 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
314 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  36.96 
 
 
312 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  36.96 
 
 
312 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  36.96 
 
 
312 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  36.96 
 
 
312 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  36.96 
 
 
312 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  36.96 
 
 
312 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  39.65 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 
291 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
301 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  34.08 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 
298 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  32.4 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  30.34 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  35.03 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  31.56 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  31.45 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  31.71 
 
 
293 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 
305 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  30.82 
 
 
298 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.17 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.79 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.41 
 
 
303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  28.79 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.03 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.79 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.03 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.17 
 
 
303 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  34.41 
 
 
322 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.79 
 
 
303 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  32.52 
 
 
297 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  31.36 
 
 
293 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.79 
 
 
303 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.27 
 
 
302 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.53 
 
 
333 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  34.62 
 
 
310 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  32.17 
 
 
297 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  31.6 
 
 
309 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  32.08 
 
 
297 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  29.9 
 
 
296 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  27.56 
 
 
341 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  29.55 
 
 
296 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  30.63 
 
 
299 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  34.06 
 
 
315 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  29.33 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  34.68 
 
 
325 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.97 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  31.8 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  31.01 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.5 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  31.67 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2730  hypothetical protein  34.14 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>