20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0513 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  322  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.11 
 
 		 338 aa  71.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  33.71 
 
 		 321 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  31.93 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  28.07 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  28.47 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  33.61 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  33.58 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  26.95 
 
 		 308 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  31.98 
 
 		 308 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  29.89 
 
 		 308 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  29.17 
 
 		 291 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.71 
 
 		 327 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 305 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  26.4 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2903  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.71 
 
 		 482 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>