55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05355 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  609  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  76.62 
 
 		 308 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  37.16 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.11 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  28.73 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  29.31 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  28.37 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  30.34 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  30.24 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  31.6 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  29.18 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  30.08 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  29.64 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  27.24 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  25.1 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  25.78 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.65 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  27.6 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  30.92 
 
 		 168 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  23.92 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  24.92 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  25.8 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.24 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  25.28 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  26.2 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  24.22 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  24.13 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  23.21 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.64 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.25 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  24.65 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  21.13 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  25.34 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.58 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  32 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.06 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  25.54 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  27.81 
 
 		 280 aa  42.7  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  24.64 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  21.88 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>