145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1531 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  518  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.79 
 
 
259 aa  184  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 
302 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
284 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  30.83 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  29.69 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  29.58 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  32.76 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  29.46 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  27.66 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  29.39 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  29.39 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  30.67 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  30.66 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  27.87 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  28.63 
 
 
294 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  28.63 
 
 
294 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
297 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
298 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  29.44 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  28.77 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  27.64 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  28.41 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  27.49 
 
 
316 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  27.34 
 
 
300 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.5 
 
 
277 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 
301 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  26.72 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  22.58 
 
 
302 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.78 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  28.11 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  28.75 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.18 
 
 
308 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0670  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.407071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.17 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.64 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.81 
 
 
297 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  23.95 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  23.28 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  23.9 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  24.81 
 
 
303 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 
293 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.99 
 
 
316 aa  49.3  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  26.42 
 
 
327 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.39 
 
 
299 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  27.67 
 
 
299 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  26.71 
 
 
304 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  22.26 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  23.88 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.18 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  28.17 
 
 
281 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  22.26 
 
 
303 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  22.26 
 
 
303 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  22.26 
 
 
303 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  22.64 
 
 
303 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  28.4 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  31.95 
 
 
279 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  28.17 
 
 
281 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  26.59 
 
 
296 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  26.59 
 
 
296 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  26.59 
 
 
296 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  24.25 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  23.99 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  22.26 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  26.26 
 
 
304 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.34 
 
 
317 aa  45.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  24.22 
 
 
308 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  22.26 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3031  hypothetical protein  25.93 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  25.82 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  22.26 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  25.1 
 
 
298 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  22.22 
 
 
308 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 
314 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  24.25 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  26.46 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  26.46 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  26.46 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>