225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2761 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  86.98 
 
 
318 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.33 
 
 
307 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.52 
 
 
305 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  41.18 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  43.67 
 
 
300 aa  175  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.03 
 
 
302 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.53 
 
 
300 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.82 
 
 
300 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.82 
 
 
302 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.42 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  38.33 
 
 
297 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  38.33 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.35 
 
 
302 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  39.93 
 
 
305 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  40.8 
 
 
310 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  36.79 
 
 
300 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 
304 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  36.79 
 
 
302 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.51 
 
 
298 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  36.55 
 
 
294 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.14 
 
 
307 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 
300 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.85 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.56 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  36.55 
 
 
294 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  36.55 
 
 
294 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  36.21 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  36.21 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  35.45 
 
 
295 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  35.29 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  38.61 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  36.12 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  37.15 
 
 
295 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.67 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  34.26 
 
 
286 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  32.03 
 
 
303 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  31.67 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  31.67 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  31.67 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  31.67 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  31.32 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  31.67 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  31.32 
 
 
309 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  31.67 
 
 
303 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  31.87 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  30.22 
 
 
303 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  41.33 
 
 
277 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  36.88 
 
 
285 aa  106  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  36.29 
 
 
283 aa  105  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 
286 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  35.78 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  35.64 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  34.18 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  34.17 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.69 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  32.88 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  33.76 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  32.78 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.37 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  35.59 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  30.33 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  28.07 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  28.93 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.38 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  30.77 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  26.09 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  26.01 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  29.27 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  27.21 
 
 
312 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  26.95 
 
 
301 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  26.87 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  27.73 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  25.94 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.23 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.15 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  29.01 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 
314 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.52 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>