91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4832 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 289 aa  570  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  71.08 
 
 		 287 aa  421  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.09 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.56 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.02 
 
 		 296 aa  161  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  32.54 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  32.97 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  32.97 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  30.82 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  34.38 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.87 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  30.07 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  26.85 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  26.85 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  26.85 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  27.55 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  28.28 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  29.89 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  29.11 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  27.85 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  28.38 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  29.93 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  26.57 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  30.17 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  26.67 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  28.04 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  27.89 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  27.4 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  26.28 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  25.75 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  27.56 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  27.6 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  26.59 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  28.91 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  26.01 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.86 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  26.28 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  26.28 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.59 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  28.89 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.94 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.42 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.22 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  26.82 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.52 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  26.59 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  26.58 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.01 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.22 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  25.93 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  22.14 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  25.46 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  29.11 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.2 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  25.84 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  25.84 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  25.84 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.94 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  26.79 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.21 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 		 300 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  25.28 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  24.75 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  23.89 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.31 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  23.75 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  25.84 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  30.89 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  23.75 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25.47 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  30.6 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.72 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  25.76 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  25.86 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  23.19 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  21.72 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  23.08 
 
 		 301 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  22.22 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>