209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5227 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  40.74 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  41.28 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  45.02 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  42.14 
 
 		 281 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  37.07 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  39.93 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  37.72 
 
 		 320 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  35.76 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  38.25 
 
 		 532 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.11 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.76 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  36.96 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  37.02 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  36.01 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  36.91 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  36.69 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  37.32 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.69 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  34 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  30.66 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 		 382 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  26.96 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.04 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.48 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  26.13 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.67 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.51 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.39 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  25.91 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  25.91 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  25.44 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.89 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.8 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.04 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  25.1 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  24.74 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  28.03 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  24.53 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.99 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.39 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  26.25 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.45 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.26 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  26.04 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  25.81 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25.83 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.52 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.71 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.71 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  27.44 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.98 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  26.72 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.34 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.34 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.34 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.51 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  27.16 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.16 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  21.98 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  27.16 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.38 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  25.93 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  27.16 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  27.8 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.72 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.72 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.14 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  26.69 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.09 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  26.69 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  23.65 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  25.35 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  26.06 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.9 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  23.74 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2318  hypothetical protein  25.16 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000243844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.08 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  23.46 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  24.46 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  26.06 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  23.86 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.18 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.47 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  25.7 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  25.7 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  21.93 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>