162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1225 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  583  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  67.68 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  69.12 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.77 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  69.12 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  67.88 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  64.57 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  67.6 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  51.18 
 
 		 532 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  49.49 
 
 		 299 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.96 
 
 		 305 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.54 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  48.61 
 
 		 325 aa  248  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  46.53 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.56 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.74 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  45.77 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  45.8 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  42.35 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  41.18 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  33.45 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  34.02 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  34.13 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  33.89 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.76 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  32.51 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.33 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  31.8 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.07 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.07 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.87 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.8 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  27.46 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.97 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.35 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.28 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.66 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.88 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.41 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  33.92 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  22.22 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.38 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.07 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.67 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  28.72 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.08 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  32.12 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.77 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  27.41 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.83 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25.96 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  23.88 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  23.63 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  23.63 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  23.4 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  23.67 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  23.67 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.99 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.59 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.08 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.99 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.67 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.56 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.08 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  20.63 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  20.8 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.32 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  25.51 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  27.74 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  27.76 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  25.51 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  25.51 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.59 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  25.51 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.67 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  25.46 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  26.42 
 
 		 353 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  23.67 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  23.18 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>