190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2506 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  87.58 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.89 
 
 		 305 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.21 
 
 		 305 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  68.58 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  51.53 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  48.07 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  51.21 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  49.49 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.32 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  48.11 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.44 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  46.32 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.03 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  48.48 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  47.59 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  47.77 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  46.81 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  42.65 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  33.11 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  38.38 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  34.26 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  30.74 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  31.91 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.53 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.4 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  30.18 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.41 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.48 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.27 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.89 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.61 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.61 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.35 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.26 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.54 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  21.48 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.64 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.26 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.61 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.86 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.97 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.64 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.26 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.66 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  23.66 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.49 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.87 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.64 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  24.07 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.44 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.72 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.13 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  23.71 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.14 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  26.92 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  31.12 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.09 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  23.71 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.74 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.81 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  27.73 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  26.05 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  27.69 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2930  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  27.83 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.01 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.89 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  26.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  25.5 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  26.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  25.5 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  22.51 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  25.5 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  22.51 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  25.1 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  22.51 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  25.5 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  22.75 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  27.09 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.54 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>