137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2234 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  76.25 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  77.52 
 
 
323 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  80.82 
 
 
325 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  78.42 
 
 
309 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  73.8 
 
 
316 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  67.11 
 
 
306 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  63.91 
 
 
302 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  51.21 
 
 
299 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  47.28 
 
 
532 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.67 
 
 
305 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 
305 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  47.87 
 
 
308 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.8 
 
 
306 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  43.84 
 
 
325 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  44.41 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.66 
 
 
382 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  44.18 
 
 
308 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  40.86 
 
 
281 aa  176  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 
313 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  32.54 
 
 
302 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  37 
 
 
319 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  34.01 
 
 
328 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  29.84 
 
 
313 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  28.01 
 
 
322 aa  85.9  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.86 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.9 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  32.89 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.06 
 
 
289 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  31.06 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.53 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  28.93 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.47 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.64 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.03 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  22.42 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  20.07 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.92 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.14 
 
 
300 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.18 
 
 
309 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.5 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  27.62 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  27.12 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  27.95 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  25.09 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.6 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  19.26 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  28.14 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25.91 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  20.58 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  27.43 
 
 
293 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  27.8 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  27.88 
 
 
309 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  27.88 
 
 
309 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  24.59 
 
 
288 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  27.53 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  24.92 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  20.97 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.47 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  23.81 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  23.81 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.83 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  20.42 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.29 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  27.43 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  21.35 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  29.96 
 
 
334 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.61 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  24.41 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  24.41 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.17 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  28.52 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.17 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.63 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  27.87 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  29.96 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
311 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.31 
 
 
291 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  29.1 
 
 
293 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.47 
 
 
297 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  29.1 
 
 
293 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.5 
 
 
330 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  30.34 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  26.16 
 
 
286 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>