216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3877 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  81.7 
 
 		 325 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  80.81 
 
 		 322 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  80.47 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  74.58 
 
 		 323 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.53 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  68.04 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  67.68 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  48.87 
 
 		 308 aa  272  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.68 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.07 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  46.23 
 
 		 532 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  48.11 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.63 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  43.42 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.78 
 
 		 382 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  42.37 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  44.33 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  42.55 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.72 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  38.74 
 
 		 319 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  31.4 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  31.53 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  31.11 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  28.71 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.39 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.4 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.22 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  23.5 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.77 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.75 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.91 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  27.69 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.47 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.77 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  28.77 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.83 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  28.17 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  27.71 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.42 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  31.48 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  29.96 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.94 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  27.92 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  27.42 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.77 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.77 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  29.7 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.49 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  32.05 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  28.09 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  27.39 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.09 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  28.12 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.09 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25.78 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  26.26 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.51 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  25.26 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.86 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  20.69 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  28 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  27.39 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  22.82 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.18 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  31.97 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  25.44 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  28 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  22.82 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  18.79 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  27.41 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  27.98 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  26.84 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0610  hypothetical protein  23.75 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00052369  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  29.61 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>