121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1364 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  87.46 
 
 		 382 aa  534  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  48.07 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  46.67 
 
 		 532 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  46.33 
 
 		 308 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.67 
 
 		 305 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  47.92 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.5 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  43.42 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  46.69 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  48.61 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  46.13 
 
 		 309 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  43.84 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.53 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  45.8 
 
 		 323 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  40.13 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  37.38 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  31.99 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  36.96 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  31.47 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  28.66 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  24.28 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  24.44 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25.87 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  27.03 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.7 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  23.7 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.33 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  24.32 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.51 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.87 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  24.58 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  26.05 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.69 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  23.57 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  24.5 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  22.74 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.59 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  25.82 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  24.05 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  26.04 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  23.26 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  24.24 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  26.36 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  24.3 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  23.24 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  24.3 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  24.3 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  23.86 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.46 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  27.42 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0110  hypothetical protein  23.81 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  22.56 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.74 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  23.42 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  23.42 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  23.42 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  23.42 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  23.58 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  23.42 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  23.42 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4075  hypothetical protein  23.17 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  19.65 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  23.55 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.71 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.27 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  23.14 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.05 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  18.92 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  19.14 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.3 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.24 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  22.82 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  24.48 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  24.48 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  24.5 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  26.13 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  23.89 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  24.38 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  22.71 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.85 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.25 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.47 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.72 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>