156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0333 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  578  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.8 
 
 		 309 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  29.72 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  29.87 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  29.87 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  28.07 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  27.43 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  27.88 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  28.68 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  31.46 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.3 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  26.55 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  29.12 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.92 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.92 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.26 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.99 
 
 		 397 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.49 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.03 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  29.8 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  26.32 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  29.24 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  29.74 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  29.1 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.96 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.18 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  26.57 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.16 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  26.82 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.67 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  28.32 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  28 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  28.19 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  25.82 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  28.29 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  23.86 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  27.78 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  27.66 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  28 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  24.9 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  22.15 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  31.34 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  31.38 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  26.81 
 
 		 255 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  24.9 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  25.75 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  23.16 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  22.49 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  22.09 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  27.41 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.39 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.05 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.36 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  23.08 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.86 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  22.49 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  25.57 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  26.55 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  25.33 
 
 		 532 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.27 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.85 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  26.95 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  31.18 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.15 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  25.57 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  30.11 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  26.54 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  28.02 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  26.48 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  26.52 
 
 		 353 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  26.52 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  27.24 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  26.52 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  23.02 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  27.75 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>