More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1932 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  98.87 
 
 
353 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  98.88 
 
 
356 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  98.88 
 
 
356 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  92.67 
 
 
402 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  80.61 
 
 
309 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  79.93 
 
 
309 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  82.93 
 
 
309 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  82.64 
 
 
309 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  82.29 
 
 
309 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  82.33 
 
 
397 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  82.29 
 
 
309 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  57.14 
 
 
308 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  57.95 
 
 
312 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.96 
 
 
311 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.95 
 
 
311 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  55.91 
 
 
312 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  49.26 
 
 
302 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  42.45 
 
 
305 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  33.02 
 
 
302 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 
298 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 
298 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.71 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  34.97 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 
310 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 
332 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  28.28 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  28.36 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  28.72 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  33.56 
 
 
316 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  24.83 
 
 
288 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
289 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  30.18 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.32 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  37.64 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.62 
 
 
315 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  31.33 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  35.62 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.98 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  34.8 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.62 
 
 
304 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.08 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.35 
 
 
289 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  30.54 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.66 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  27.22 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  31.91 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.52 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  31.72 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25.64 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.91 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  30.54 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.09 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  28.91 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  33.11 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  33.11 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.09 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  33.11 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  29.69 
 
 
292 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  31.83 
 
 
319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  33.82 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.55 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  31.18 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  25.26 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.86 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  32.14 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  28.82 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  29.37 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  24.92 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  30.85 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  34.88 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.41 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  24.01 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  28.36 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  29.41 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  29.19 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.48 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  26.91 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  27.11 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  32.38 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.34 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  32.7 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  30.41 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.43 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>