More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0900 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  93.11 
 
 
331 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  93.11 
 
 
331 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  93.05 
 
 
310 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  86.02 
 
 
319 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  88.14 
 
 
319 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  83.28 
 
 
319 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  73.62 
 
 
311 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  77.21 
 
 
312 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  76.87 
 
 
312 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  77.99 
 
 
268 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  77.99 
 
 
268 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  77.99 
 
 
268 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  76.69 
 
 
236 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.29 
 
 
299 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.03 
 
 
298 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.31 
 
 
305 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.31 
 
 
305 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.5 
 
 
301 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  51.35 
 
 
296 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  48.03 
 
 
300 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  53.28 
 
 
287 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  52.46 
 
 
309 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  51.16 
 
 
301 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  48.56 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.04 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.02 
 
 
299 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  31.63 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  31.1 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  31.1 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  31.68 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  31.68 
 
 
302 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  30.07 
 
 
299 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  30.69 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  31.45 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  29.41 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  29.41 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  29.41 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  30.67 
 
 
299 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  32.3 
 
 
307 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  32.24 
 
 
306 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 
312 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  27.99 
 
 
333 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  28.53 
 
 
315 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 
308 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 
315 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  27.78 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  31.25 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  31.49 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  36.03 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  25.08 
 
 
304 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  25.08 
 
 
304 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  28.08 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  30.1 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  27.55 
 
 
318 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  26.49 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.48 
 
 
305 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.93 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.55 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.53 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.56 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.21 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  31.52 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.93 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.04 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  23.62 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  27.8 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.48 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.44 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  24.54 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.08 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.26 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.32 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  24.9 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.51 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.17 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  22.3 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.24 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.89 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.59 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  23.36 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.19 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  31.11 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  26.23 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  28.67 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.92 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  32.61 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.85 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  22.59 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.42 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  32.04 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  28.67 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.57 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>