170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4081 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  547  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  45.91 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  49.64 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.14 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  43.73 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  42.65 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  42.61 
 
 		 532 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  44.29 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.25 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  37.37 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  41.64 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.33 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  42.55 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.09 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  42.24 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  40.86 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  41.46 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  42.35 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  41.99 
 
 		 309 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.25 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  36.96 
 
 		 325 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  34.75 
 
 		 328 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  32.74 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  32.39 
 
 		 322 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.58 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.74 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.74 
 
 		 397 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.47 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.47 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.01 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.01 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.72 
 
 		 308 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.31 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  28.47 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.93 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  27.62 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  27.62 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  27.62 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  27.62 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  27.62 
 
 		 353 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  27.62 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  27.62 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.44 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.13 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.62 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  28.2 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.22 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.51 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.21 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.13 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.13 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.34 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.22 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.13 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.76 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.76 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.76 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  26.89 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  29.9 
 
 		 309 aa  62  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.89 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.53 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.21 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  24.91 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  25.81 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  26.47 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.51 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.44 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.8 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.56 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.26 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  23.68 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  29.64 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  27.64 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.14 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  24.45 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  26.32 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.84 
 
 		 300 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.05 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.33 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  22.86 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  27.23 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  25.4 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.15 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  23.08 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  28.19 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.44 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>