81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02208 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  33.56 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  37.85 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  30.26 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  35.27 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  30.16 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  30.34 
 
 		 532 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  31.11 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  34.02 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  31.47 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  30.74 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  31.06 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  33.57 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  31.62 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  30.48 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  29.19 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  32.74 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  24.92 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  26.18 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.82 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  25.34 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  25.34 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.57 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  25.8 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  24.74 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  25.85 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  25 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.91 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  25 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.9 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  24.57 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.64 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  26.32 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  22.1 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  23.89 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  24.28 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  24.82 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  24.32 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  24.37 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.96 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  23.37 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  24.81 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0269  hypothetical protein  23.44 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  24.82 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  28.87 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.49 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24.53 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  23.05 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24.56 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  25.57 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1445  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.154622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  26.4 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  25.58 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  29.05 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.06 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  25.76 
 
 		 402 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  25.41 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  23.94 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  25.62 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.96 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.31 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  21.51 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.31 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>