251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1883 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  615  1e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  48.99 
 
 
360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.92 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.43 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  38.87 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.99 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 
300 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.99 
 
 
309 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  29.53 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  27.33 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  29.01 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  29.1 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  27.83 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  27.97 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  30.03 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  28.81 
 
 
306 aa  109  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  29.69 
 
 
301 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.2 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  29.35 
 
 
301 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  29.35 
 
 
303 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  28.96 
 
 
311 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
312 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  29.01 
 
 
303 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  29.01 
 
 
303 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  29.01 
 
 
303 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  29.01 
 
 
303 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
308 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  28.67 
 
 
303 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  28.62 
 
 
312 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  27.5 
 
 
305 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  27.81 
 
 
305 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  26.78 
 
 
295 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
301 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  30.96 
 
 
288 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  32.43 
 
 
286 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  27.74 
 
 
314 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  28.67 
 
 
303 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.54 
 
 
295 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  26.21 
 
 
307 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  27.52 
 
 
358 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  26.44 
 
 
295 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
295 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  27.52 
 
 
316 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 
308 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.21 
 
 
299 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
283 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 
294 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  27.15 
 
 
307 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  30.25 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  28.77 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  27.62 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  30.43 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  26.35 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  26.01 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  24.92 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  26.94 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  25.5 
 
 
310 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  27.46 
 
 
288 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  27.46 
 
 
288 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 
296 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  26.51 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  27.87 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 
291 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  29.01 
 
 
277 aa  92  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.91 
 
 
289 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  24.31 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  26.24 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  25.77 
 
 
293 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  25.73 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  26.25 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  28.87 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  29.68 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  25.41 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  25.08 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  24.75 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  28.27 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  26.04 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  24.75 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  27.72 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  28.12 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  26.52 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  24.91 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  24.41 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  28.78 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  30 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  25.91 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>