172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1621 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
293 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 
290 aa  115  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
290 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  28.17 
 
 
295 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
289 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.15 
 
 
290 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  27.49 
 
 
301 aa  99.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  27.04 
 
 
310 aa  93.6  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  29.75 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
318 aa  92.8  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  30.95 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 
301 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.17 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  27.56 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.52 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  29.79 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  28.37 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  28.35 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  26.61 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  27.5 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  26.61 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  26.77 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.39 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  26.21 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  27.37 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  28.93 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  27.1 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  28.57 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.88 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  28.21 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  27.63 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  29.76 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  27.86 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  27.86 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  27.86 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  28.21 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  27.86 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  27.63 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  27.86 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  24.74 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  29.17 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  28.5 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  30.4 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  30.65 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  25.18 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  30.65 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  32.5 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  31.67 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.29 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  29.37 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  31.71 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  29.52 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  26.26 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  27.68 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  26.69 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  23.9 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  23.9 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.17 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  24.89 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  27.61 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  25.09 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  25.33 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  28.57 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  24.8 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  24.41 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  28.11 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  24.35 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  27.98 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  25.2 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  26.89 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  26.61 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  26.3 
 
 
320 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  25.35 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  29.1 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  29.17 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  25.44 
 
 
322 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  24 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>