223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1728 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  100 
 
 
302 aa  585  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  54.75 
 
 
307 aa  299  4e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  51.38 
 
 
294 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.3 
 
 
301 aa  251  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  46.53 
 
 
306 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  48.48 
 
 
292 aa  225  6e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  40.2 
 
 
301 aa  185  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  40.53 
 
 
303 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  40.53 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  40.2 
 
 
301 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.44 
 
 
312 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  39.87 
 
 
303 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  39.53 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  39.53 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  39.53 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  39.53 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  39.53 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  39.53 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  38.97 
 
 
292 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.98 
 
 
308 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  34.74 
 
 
319 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 
302 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  35.81 
 
 
322 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  37.37 
 
 
286 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 
302 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.91 
 
 
293 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  32.77 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 
293 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.87 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.58 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  36.67 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 
315 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  31.03 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  30.49 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.9 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  31.74 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 
290 aa  114  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.2 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
292 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.27 
 
 
295 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  29.79 
 
 
299 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  30.93 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  28.48 
 
 
307 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 
301 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.39 
 
 
299 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  28.57 
 
 
305 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.48 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  32.47 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  27.24 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  30.24 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  28.47 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  28.47 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  28.78 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  28.52 
 
 
312 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  30.29 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  28.78 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.43 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  27.5 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  29.24 
 
 
279 aa  92.8  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  29.28 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 
304 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  26.19 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  28.86 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  24.73 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  26.87 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  27.97 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  30 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 
304 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  26.19 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  26.41 
 
 
300 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  27.98 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
287 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  26.46 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  27.14 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  23.39 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  24.57 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  25.25 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  26.79 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  27.14 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  26.6 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  24.57 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  29.96 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  25.33 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  24.19 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  25.33 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  24.52 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  27.82 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>