178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1171 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
306 aa  597  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 
293 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.21 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  26.74 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  22.78 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  27.24 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  25.25 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  29.69 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  24.48 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  27.4 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  27.48 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  25.26 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  28.17 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.49 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  32.69 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.42 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  27.55 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  25.09 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  27.14 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  23.32 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.66 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  24.41 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  26.06 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  23.4 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  25.8 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  27.68 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.72 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  24.41 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  28.12 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  24.41 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  24.41 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  24.41 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.36 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  23.91 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  24.75 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  26.39 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  27.05 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  26.62 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  22.92 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  23.76 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  26.96 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  25.26 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  27.96 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  24.75 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  26.8 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.03 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  26.96 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  25.59 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.08 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  24.51 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  22.9 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  25.09 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  26.52 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  26.52 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  27.3 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.2 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  22.22 
 
 
288 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  22.22 
 
 
288 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  25.42 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.39 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  30.09 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  22.06 
 
 
307 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  26.23 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  26.3 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  22.69 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  26.71 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  24 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  24.03 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  22.95 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  24.05 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  22.68 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48145  predicted protein  25.33 
 
 
462 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196185  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  26.98 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  25.52 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  27.08 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  23.39 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  24.1 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  25.18 
 
 
360 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  22.15 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  22.68 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  22.86 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  22.05 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>