204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03280 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  100 
 
 
309 aa  608  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  63.99 
 
 
331 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.96 
 
 
347 aa  247  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  26.78 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.48 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  29.96 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.42 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  26.39 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  29.34 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.68 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  30.88 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.41 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  30.09 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.64 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  28.27 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  24.14 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.35 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  27.14 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  30.63 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.82 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  24.46 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  28.9 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  27.74 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.5 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  26.24 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.09 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.99 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  25.33 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  24.92 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  28.19 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  25.9 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
293 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  27.02 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  28.19 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  27.66 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  27.66 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  24.01 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18490  DMT family transporter: drug/metabolite  30.23 
 
 
302 aa  62.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00171701  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  27.66 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  27.66 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  27.66 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  27.66 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  27.27 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  22.22 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  28.16 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  25.26 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  27.36 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  25.09 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  30.63 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 
302 aa  59.7  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  25.76 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  26.99 
 
 
358 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  26.92 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  26.13 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  23.43 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  27.86 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  30.09 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  27.98 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  29.06 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  25.95 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  26.7 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  23.44 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  25.09 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  27.05 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  25.95 
 
 
303 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
302 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  29.06 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  25.42 
 
 
288 aa  56.2  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  27.05 
 
 
292 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  27.91 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  27.91 
 
 
295 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27 
 
 
343 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  27.44 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  27.35 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  24.71 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  26.92 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  35.66 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  26.88 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  27.7 
 
 
294 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  22.97 
 
 
301 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>