252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  100 
 
 
290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.96 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.78 
 
 
312 aa  228  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  43.45 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.14 
 
 
313 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.97 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  38.52 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  37.36 
 
 
360 aa  168  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  31.03 
 
 
335 aa  155  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  31.94 
 
 
311 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.48 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.72 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  29.64 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 
292 aa  125  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  31.43 
 
 
295 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
301 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.97 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  28.73 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
290 aa  113  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 
308 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  27.7 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.28 
 
 
303 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  25.52 
 
 
301 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  30.74 
 
 
288 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  30.74 
 
 
288 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  26.28 
 
 
303 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  26.28 
 
 
303 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  26.28 
 
 
303 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  26.28 
 
 
303 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  26.28 
 
 
303 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
294 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  29.24 
 
 
294 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  27.46 
 
 
305 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  29.37 
 
 
289 aa  102  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  29.76 
 
 
308 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  25.94 
 
 
303 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  32.56 
 
 
304 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  34.15 
 
 
317 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  31.99 
 
 
300 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  26.46 
 
 
301 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
313 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  25.26 
 
 
301 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  29.97 
 
 
316 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  29.97 
 
 
358 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  26.12 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  29.12 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  27.01 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  30.14 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 
301 aa  99  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.36 
 
 
295 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.05 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.05 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  29.27 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  29.97 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 
304 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  28.72 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  27.68 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  30 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  30.47 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
304 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  29.5 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  28.37 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  30.18 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.07 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  32.13 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  29.64 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  29.31 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  30.07 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  30.03 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  29.07 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  29 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  29.37 
 
 
288 aa  92.8  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  30.48 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 
296 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  27.81 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  31.16 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  29.47 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  29.31 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  29.63 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  31.15 
 
 
312 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  30.98 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.85 
 
 
152 aa  89.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  30.33 
 
 
296 aa  89  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  27.93 
 
 
307 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  27.48 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  27.48 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  27.15 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  27.48 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  29.27 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>