More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2142 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
308 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.89 
 
 
312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  49.66 
 
 
301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  50 
 
 
303 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  50 
 
 
303 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  48.63 
 
 
303 aa  262  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  50 
 
 
303 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  50 
 
 
303 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  50 
 
 
303 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  50 
 
 
303 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  49.66 
 
 
303 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  49.66 
 
 
301 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  47.95 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  44.77 
 
 
319 aa  215  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  45.72 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 
301 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  44.86 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  42.07 
 
 
286 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  41.55 
 
 
293 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.12 
 
 
302 aa  189  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  38.98 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.72 
 
 
302 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  41.03 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  38.72 
 
 
294 aa  168  8e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  37.1 
 
 
322 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  38.83 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.79 
 
 
343 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  36.79 
 
 
299 aa  158  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  38.54 
 
 
301 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.64 
 
 
283 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  33.89 
 
 
299 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  34.45 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  35.69 
 
 
288 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  35.69 
 
 
288 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.73 
 
 
315 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  31.39 
 
 
295 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  33.55 
 
 
310 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.54 
 
 
296 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.64 
 
 
294 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 
293 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 
301 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.13 
 
 
252 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  35.54 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  34.54 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  32.89 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  33.79 
 
 
277 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  33.56 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  33.91 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  31.6 
 
 
307 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  35.29 
 
 
316 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  33.91 
 
 
295 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  31.94 
 
 
295 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.03 
 
 
295 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 
295 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  35.29 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  32.78 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  31.46 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  32.18 
 
 
295 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  32.89 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.03 
 
 
289 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  32.11 
 
 
288 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  32.2 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  33.56 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  32.79 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  35.11 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  33.01 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  31.33 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2982  DMT family permease  35.79 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  31.09 
 
 
307 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  32.23 
 
 
308 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  34.22 
 
 
316 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.05 
 
 
304 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  32.65 
 
 
323 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
297 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  33.82 
 
 
279 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  31.54 
 
 
303 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  31.54 
 
 
303 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
304 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  30.13 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  34.19 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  33.56 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  31.51 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  32.53 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 
291 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  33.69 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  31.33 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  34.95 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.01 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
296 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  32.65 
 
 
317 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  31.29 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  31.62 
 
 
296 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  33.69 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>