247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3690 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
296 aa  577  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  92.91 
 
 
310 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  71.1 
 
 
336 aa  407  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  66.33 
 
 
307 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  65.99 
 
 
307 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  65.64 
 
 
307 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  65.98 
 
 
307 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  65.66 
 
 
309 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  65.66 
 
 
307 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  65.66 
 
 
309 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  67.38 
 
 
323 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  67.38 
 
 
306 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  67.38 
 
 
306 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  67.38 
 
 
306 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  67.38 
 
 
306 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  67.38 
 
 
306 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  67.38 
 
 
306 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  66.9 
 
 
307 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  52.65 
 
 
323 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  54.7 
 
 
297 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  54.61 
 
 
308 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  47.52 
 
 
299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  46.35 
 
 
295 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.35 
 
 
295 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  45.99 
 
 
295 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  47.08 
 
 
312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  46.72 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  49.11 
 
 
298 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  45.99 
 
 
302 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  45.99 
 
 
295 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.1 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.37 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 
302 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  37.1 
 
 
293 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.32 
 
 
296 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  42.47 
 
 
320 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 
287 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  37.2 
 
 
303 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  36.86 
 
 
303 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  37.88 
 
 
300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  35.93 
 
 
300 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
301 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  35.12 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  36.59 
 
 
296 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  32.36 
 
 
293 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  33.45 
 
 
294 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  29.87 
 
 
303 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  29.29 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  29.29 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  29.63 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  29.29 
 
 
303 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  29.29 
 
 
303 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  29.29 
 
 
303 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.54 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  29.63 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  27.95 
 
 
301 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  28.96 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  28.62 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 
312 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  35.94 
 
 
296 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.98 
 
 
298 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
301 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  28.99 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 
302 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  30.94 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  32.52 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 
302 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
290 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
300 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  26.01 
 
 
295 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
292 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  27.76 
 
 
296 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
308 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
308 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 
297 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  28.06 
 
 
304 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  28.87 
 
 
292 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  32.49 
 
 
288 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
315 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
312 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  31.82 
 
 
305 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  31.93 
 
 
299 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.04 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  26.74 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  26.79 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.83 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  28.83 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  28.82 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  31.69 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  26.86 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  26.87 
 
 
306 aa  94  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  26.38 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>