197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1007 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  682    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  50.9 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  34.83 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.32 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  30.6 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 		 289 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  27.17 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  25.08 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  24.76 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  28.33 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  26.21 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  23.67 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  24.41 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  24.36 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  23.63 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.63 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  23.63 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  23.67 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  23.97 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  24.66 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  28.93 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  24.24 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  25.26 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  24.26 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  23.23 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  23.93 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.46 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.23 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  31.4 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  24.14 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  27.09 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  23.47 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  26.94 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  28.97 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  28.84 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.23 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  29.07 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  29.18 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  25.34 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  25.32 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  24.8 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.46 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  26.34 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  22.73 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.83 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  21.71 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  22.44 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  23.53 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  24.75 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  25.61 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  25.41 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  24.09 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  23.43 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.53 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  25.71 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  22.15 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  24.75 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  24.76 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  23.13 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  23.13 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  23.13 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  21.8 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  25.85 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  26.24 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  23.13 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  23.13 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  23.13 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  23.13 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  25 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  32.41 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  24.66 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149977  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.83 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  23.89 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  24.41 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.29 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  24.46 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  26.04 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  22.3 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  24.74 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.84 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  25.94 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>