242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0322 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  100 
 
 
311 aa  623  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  50.9 
 
 
335 aa  287  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.18 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  35.44 
 
 
309 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  35.09 
 
 
360 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.49 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 
313 aa  142  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  30.04 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  26.69 
 
 
307 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  25.34 
 
 
307 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  31.91 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  33.45 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  31.87 
 
 
312 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  30.45 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  30.45 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  29.25 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  26.8 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  29.83 
 
 
316 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  26.3 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
283 aa  89.7  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  28.32 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  28.31 
 
 
288 aa  89  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  23.78 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.83 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  24.83 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  24.83 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  24.83 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  27.72 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  28.76 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  27.05 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.95 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  26.13 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  27.46 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  25.61 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  27.46 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.76 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  25.5 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  28.79 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  26.57 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  29 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  29.14 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  26.33 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  23.65 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  23.73 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  26.83 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  28.52 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  25.33 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  25.56 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  23.74 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  23.74 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  27.23 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  23.74 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  23.74 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  23.74 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  23.74 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  23.74 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  23.43 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  25.94 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  25.94 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.04 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  27.92 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  28.24 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  24.91 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  27.3 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  25.37 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  29.79 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  25.52 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  26.19 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  26.19 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  26.19 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  26.19 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  28.45 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  26.19 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  26.41 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  24.74 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  25.51 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  25.85 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  25.85 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.33 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>